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1.
Braz. j. biol ; 80(1): 167-179, Feb. 2020. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1089284

ABSTRACT

Abstract During the last years Phytophthora infestans sensu lato (Mont. De Bary) has caused epidemics in Colombia in Andean fruit crops such as Solanum quitoense and Solanum betaceum. Establishment of new or modified experimental procedures to study this pathogen is a mandatory subject for scientists. Twelve isolates of Phytophthora spp. obtained from six different Solanum hosts in Colombia were used to evaluate the effect of five different solid media for growth and ability to produce sporangia and liberate zoospores. Determination of the best media culture and optimal growth temperature were necessary to perform measurements and correlate the provenance of isolates with phenotypic traits. Modifications were made to use ingredients available in local markets on the following media: lime bean agar (LBA), Tree tomato or tree tomato agar (TA), carrot agar (AZ), Rye A modified agar and 32% non-clarified V8 agar. Cardinal temperature determination was performed at 10, 15, 20, and 25 °C. Morphometric traits were measured once the optimal media culture and temperature were defined. Correlation analysis showed that there is a relationship between the host and isolate's preferences for media culture and optimal growth temperature. In addition, the production of characteristic sporangia, sporangiophore and mycelia was related with the media type used and host from which the isolate was collected. In this work useful information was provided to make studies about the biology and development of isolates gathered from cultivated and wild non-traditional hosts.


Resumo Durante os últimos anos Phytophthora infestans sensu lato causou epidemias na Colômbia em lavouras de frutos andinos, como Solanum quitoense e Solanum betaceum. Estabelecimento de procedimentos experimentais novos ou modificados para estudar este patógeno é um assunto obrigatório para os cientistas. Doze isolados de Phytophthora spp. obtidos de seis diferentes hosts Solanum na Colômbia foram usados para avaliar o efeito de cinco diferentes mídias sólidas para o crescimento e a capacidade de produzir esporângios e libertar zoósporos. Determinação da melhor cultura de mídia e temperatura de crescimento ideal foram necessárias para realizar medições e correlacionar a proveniência de isolados com traços fenotípica. Foram feitas modificações para usar os ingredientes disponíveis nos mercados locais nos seguintes meios: ágar do feijão de cal (LBA), tomate da árvore ou ágar do tomate da árvore (TA), ágar da cenoura (AZ), centeio um ágar modificado e 32% de ágar-V8 não-esclarecido. A determinação da temperatura Cardeal foi realizada em 10, 15, 20 e 25 °C. Traços morfométricos foram medidos uma vez que a cultura de mídia ideal e temperatura foram definidos. Análise de correlação mostrou que há uma relação entre o hospedeiro e isolar as preferências para a cultura de mídia e temperatura de crescimento ideal. Além disso, a produção de esporângios característica, esporangióforo e mycelia foi relacionada com o tipo de mídia utilizado e hospedeiros a partir do qual o isolado foi coletado. Neste trabalho foram fornecidas informações úteis para fazer estudos sobre a biologia e o desenvolvimento de isolados recolhidos de hospedeiros não-tradicionais cultivados e selvagens.


Subject(s)
Solanum tuberosum , Solanum , Phytophthora infestans , Temperature , Colombia
2.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467268

ABSTRACT

Abstract During the last years Phytophthora infestans sensu lato (Mont. De Bary) has caused epidemics in Colombia in Andean fruit crops such as Solanum quitoense and Solanum betaceum. Establishment of new or modified experimental procedures to study this pathogen is a mandatory subject for scientists. Twelve isolates of Phytophthora spp. obtained from six different Solanum hosts in Colombia were used to evaluate the effect of five different solid media for growth and ability to produce sporangia and liberate zoospores. Determination of the best media culture and optimal growth temperature were necessary to perform measurements and correlate the provenance of isolates with phenotypic traits. Modifications were made to use ingredients available in local markets on the following media: lime bean agar (LBA), Tree tomato or tree tomato agar (TA), carrot agar (AZ), Rye A modified agar and 32% non-clarified V8 agar. Cardinal temperature determination was performed at 10, 15, 20, and 25 °C. Morphometric traits were measured once the optimal media culture and temperature were defined. Correlation analysis showed that there is a relationship between the host and isolates preferences for media culture and optimal growth temperature. In addition, the production of characteristic sporangia, sporangiophore and mycelia was related with the media type used and host from which the isolate was collected. In this work useful information was provided to make studies about the biology and development of isolates gathered from cultivated and wild non-traditional hosts.


Resumo Durante os últimos anos Phytophthora infestans sensu lato causou epidemias na Colômbia em lavouras de frutos andinos, como Solanum quitoense e Solanum betaceum. Estabelecimento de procedimentos experimentais novos ou modificados para estudar este patógeno é um assunto obrigatório para os cientistas. Doze isolados de Phytophthora spp. obtidos de seis diferentes hosts Solanum na Colômbia foram usados para avaliar o efeito de cinco diferentes mídias sólidas para o crescimento e a capacidade de produzir esporângios e libertar zoósporos. Determinação da melhor cultura de mídia e temperatura de crescimento ideal foram necessárias para realizar medições e correlacionar a proveniência de isolados com traços fenotípica. Foram feitas modificações para usar os ingredientes disponíveis nos mercados locais nos seguintes meios: ágar do feijão de cal (LBA), tomate da árvore ou ágar do tomate da árvore (TA), ágar da cenoura (AZ), centeio um ágar modificado e 32% de ágar-V8 não-esclarecido. A determinação da temperatura Cardeal foi realizada em 10, 15, 20 e 25 °C. Traços morfométricos foram medidos uma vez que a cultura de mídia ideal e temperatura foram definidos. Análise de correlação mostrou que há uma relação entre o hospedeiro e isolar as preferências para a cultura de mídia e temperatura de crescimento ideal. Além disso, a produção de esporângios característica, esporangióforo e mycelia foi relacionada com o tipo de mídia utilizado e hospedeiros a partir do qual o isolado foi coletado. Neste trabalho foram fornecidas informações úteis para fazer estudos sobre a biologia e o desenvolvimento de isolados recolhidos de hospedeiros não-tradicionais cultivados e selvagens.

3.
Braz. j. microbiol ; 46(2): 397-406, Apr-Jun/2015. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-749738

ABSTRACT

Penicillum janthinellum SDX7 was isolated from aged petroleum hydrocarbon-affected soil at the site of Anand, Gujarat, India, and was tested for different pH, temperature, agitation and concentrations for optimal growth of the isolate that was capable of degrading upto 95%, 63% and 58% of 1%, 3% and 5% kerosene, respectively, after a period of 16 days, at optimal growth conditions of pH 6.0, 30 °C and 180 rpm agitation. The GC/MS chromatograms revealed that then-alkane fractions are easily degraded; however, the rate might be lower for branched alkanes, n-alkylaromatics, cyclic alkanes and polynuclear aromatics. The test doses caused a concentration-dependent depletion of carbohydrates of P. janthinellum SDX7 by 3% to 80%, proteins by 4% to 81% and amino acids by 8% to 95% upto 16 days of treatment. The optimal concentration of 3% kerosene resulted in the least reduction of the metabolites of P. janthinellum such as carbohydrates, proteins and amino acids with optimal growth compared to 5% and 1% (v/v) kerosene doses on the 12th and 16th day of exposure. Phenols were found to be mounted by 43% to 66% at lower and higher concentrations during the experimental period. Fungal isolate P. janthinellum SDX7 was also tested for growth on various xenobiotic compounds.


Subject(s)
Kerosene , Penicillium/growth & development , Penicillium/metabolism , Soil Microbiology , Soil Pollutants/metabolism , Xenobiotics/metabolism , Base Composition , Biotransformation , DNA, Fungal/chemistry , DNA, Fungal/genetics , DNA, Ribosomal/chemistry , DNA, Ribosomal/genetics , Gas Chromatography-Mass Spectrometry , Genes, rRNA , Hydrogen-Ion Concentration , India , Molecular Sequence Data , Penicillium/genetics , Penicillium/isolation & purification , RNA, Fungal/genetics , /genetics , Sequence Analysis, DNA , Temperature
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